实验动物设施按微生物控制程度不同可分为开放系统、屏障系统（全屏障系统和亚屏障系统）和隔离系统。

1.开放系统

无净化装置，基本上与大自然相通，温度、湿度、大气尘埃，都受外界环境的影响。适用于普通级实验动物的饲养繁殖。

   2.屏障系统

实验动物生活在与外界隔离的系统内，所有进入空气都须经过初、中、高三级过滤器的净化处理，洁净度为1万级；系统内应保持空气压差，不低于20 -50Pa，出风口有防止空气倒流的装置；凡进入设施的物品（含动物）均须经严格的消毒灭菌处理，经特制的传递装置送入；人员要淋浴，更换无菌衣帽。屏障系统适用无特定病原体动物饲养。

   亚屏障系统

适宜于清洁级动物饲养；其结构和设施均按屏障设施的标准要求，但在空气洁净度、菌落数等指标上低于屏障系统。

   3.隔离系统

隔离器为主体及其附属装置组成的饲养系统，用于无菌动物和已知菌动物的饲养和动物实验。送入隔离器的空气须超高效过滤，并维持一定压差，洁净度达到100级；饲料、饮水、垫料、笼具等，须经过严格灭菌之后经传递窗送入；工作人员不直接接触动物，而是通过手套进行操作。